В противостоянии двум политически и численно доминирующим религиям евреи (как караимы, так и талмудисты) в исламских странах сосредоточили свою полемику в основном на внутренних дебатах (караизма против талмудизма) и на апологетике, предназначенной исключительно для еврейских читателей, чтобы утвердить свою теологическую позицию и предотвратить возможное обращение в религии большинства, в данном случае в ислам. *
Изложенная парадигма соответствует нескольким иудео-арабским работам по антиисламской апологетике, большая часть которых возникла в Багдаде в конце десятого и начале одиннадцатого веков и которая была предназначена для внутреннего использования в качестве помощи в диспутах в местных дискуссионных залах.
Их авторами были караимы Иаков аль-Киркисани, Абу аль-Хусейн ибн Машиах и Юсуф аль-Басир.
К сожалению, сохранились только фрагменты этих произведений, или же мы узнаём об их существовании из других работ тех же авторов.
Караим Аль-Киркисани, например, рассказывает о своей монографии, опровергающей пророчество Мухаммеда, в юридическом сборнике Книга светов и сторожевых башен (Китаб аль-анвар ва-ль-маракиб), в которую он включил основные положения не сохранившейся работы. **
В ней он подробно опроверг бессмысленные утверждения мусульман о фальсификации Священного Писания, о статусе пророка Мухаммеда, о чудесной неподражаемости Корана и об аброгации (отмене) Закона.
Караизм спорил с исламом чаще и воинственнее, чем раввинский иудаизм. ***
Караим Юсуф аль-Басир, живший на рубеже X и XI веков, спорил в первую очередь с мусульманской концепцией неподражаемости Корана.

* Baron, Social and Religious History of Jews, том 5, ст. 275-283; Poznański, The Anti-Karaite Writings of Saadiah Gaon, ст. 238-276; Mann, A Polemical Work against Karaite and other sectaries, ст. 123-150 

** Аль-Киркисани, Китаб аль-анвар ва-ль-маракиб, III. 13,2, ст. 284; III. 15,1, ст. 292-301

*** Ben-Shammai, The Attitude of some Early Karaites towards Islam, ст. 3-40

Караим Соломон бен Йерухам Иерусалимский (вторая половина 10 века) описал Измаила как племя, которое причинило в истории Израилю наибольший вред.

Например часть стиха Псалом 43:2 для чего я сетуя хожу от оскорблений врага, он прокомментировал следующим образом: Царство сына раба (то есть Измаила, сына Агари) является самым сильным и жестоким из всех (четырех царств), потому что Священное Писание говорит: После сего видел я в ночных видениях, и вот зверь четвертый, страшный и ужасный и весьма сильный. ****

Образ мусульман в еврейской литературе обычно отрицательный и более или менее идентичен образу мусульман у христианских писателей.

**** Ben-Shammai, The Attitude of some Early Karaites towards Islam, ст. 10

В письменном прении с Патриархом Тимофеем I (780-823) халиф аль-Махди (775-785) объясняет, что в Библии нет свидетельств о Мухаммеде по причине, что все эти свидетельства были уничтожены и сфальсифицированы христианами, против чего Тимофей возражает, утверждая, что Священное Писание никогда не упоминало Мухаммеда, более того, если бы Мухаммед был истинным пророком, не было бы в силах людей стереть упоминание о нем. 
Возможность тахрифа (تحريف тахриф - искажение, т.е. фальсификация Священного Писания, на иврите שִׁבּוּשׁ шибуш) исключает Тимофей, среди прочего, из-за взаимной вражды христиан и евреев, из-за которой ни одна из сторон не приняла бы текстовые модификации Священного Писания другой стороны. 
Более того, христиане не смогут забрать все экземпляры Священного Писания, принадлежащие евреям. *****

Идентичным текстом Торы среди евреев и христиан с Востока на Запад, аргументировал также караим аль-Киркисани. 
Кроме того, он отмечает, что невозможно чтобы пророки не пророчествовали и прямо не упоминали такие важные события, как отмена Закона и появление нового пророка с новым законом. ******

Караим аль-Киркисани является первым еврейским автором, вспомнившим Ездру в связи с восстановлением разрушенной Торы, идея, которая может быть основана на раввинской интерпретации (bSuk 20a), обозначающей Ездру как второго Моисея, поскольку он расширил Тору после того, как она упала в забвение. 
Караим аль-Киркисани обращается к равванитам со своим упрёком и опасениями, что мусульмане узнают об этом:

Равваниты утверждают, что распространенная среди людей Тора - это не та же самая Тора, которую принес Моисей, но что она была написана Ездрой. О Торе, принесенной Моисеем, утверждают, что она была уничтожена, потерянa и исчезла. Это равносильно гибели нашей религии! Если бы мусульмане узнали об этом, им не нужно было бы ничего другого, чтобы осмеивать и ругать нас и уличить нас из заблуждения, что некоторые из их теологов обвиняют нас, говоря: Тора, которой вы уже владеете, не та, которую принес Моисей. ******* Мы утверждаем, что те, кто говорят что-то подобное, врут из жажды быть в оппозиции, и что мусульмане прибегают к таким заявлениям из-за необходимости придумать себе аргументы, потому что они не знают, что им против нас возражать. Если бы они раскрыли требования равванитов - да простит их Бог - им больше не нужно было бы ничего, чтобы возражать нам безо всяких ограничений. ********

Опасения караима аль-Киркисани оправдались. 
В одиннадцатом веке традиционный мусульманский образ Эзры как благочестивого реставратора Торы начал рушиться, и в мусульманской полемике все чаще говорят об Эзре как об её подделывателе.

***** Cheikho, Vingt traités théologiques d’auteurs arabes chrétiens, ст. 23-25; Griffith, Disputes with Muslims in Syriac Christian Texts, ст. 59-73

****** Аль-Киркисани, Китаб аль-анвар ва-ль-маракиб, III. 15,7-8, ст. 295-297; Khan, Al-Qirqisānī’s Opinions concerning the Text of the Bible, ст. 59-73

******* Аль-Киркисани, Китаб аль-анвар ва-ль-маракиб, III. 15

******** Аль-Киркисани, Китаб аль-анвар ва-ль-маракиб, I.3.3, ст. 15; II.18, II.22