Final Fantasy X-2
Príbeh sa začína s Yunou, Rikku a Paine, ktoré obnovia ukradnuté šaty zo Syndikátu Leblanc z prvej v niekoľkých stretnutiach, v ktorých súperili o sféry. Hra je prerušovaná rozprávaním Yuny, kde rozpráva o Tidusovi, ako by udalosť súvisela k nemu, ak sa vyskytnú v štýle podobnom vlastného rozprávania vo Final Fantasy X. Hoci Yuninou snahou je nájsť stopy, ktoré môžu viesť k Tidusovi, a veľa nadväzuje z predchádzajúcej časti príbehu, ktoré sa usadili v čase od príchodu večného pokoja vo Final Fantasy X a odkrytie skrytých odkazov z dávnej histórie Spira. Významné časti herných udalostí sú zbytočné pre ukončenie hlavného deja, ale veľa z hĺbky príbehu, vrátane popisu a pozadia informácií, ktoré sa uvádzali do voliteľného obsahu, ktoré všeobecne sledujú, ako Spira sa hojí v čase od konca hriechu.
K nepriateľstvu prišlo medzi mládežníckou ligou a New Yevonom. Medzitým Gullwings objavia starovekú oblasť obsahujúcu zábery obrovskéhej machina zbrani s názvom "Vegnagun", ktorý bol tajne pochovaný pod Bevelle. Zbraň má dosť sily, aby ohrozil celú Spiru, a navyše sa ukázalo, že Vegnagun nie je schopný rozlíšiť priateľa od nepriateľa, ked je aktivovaný. Gullwings potom spoja sily so Syndikátom Leblanc na preskúmanie podzemnej časti mesta v snahe zničiť stroj, aby to použili po oboch stranách v nadchádzajúcom konflikte. Avšak objavil sa veľký tunel do podlahy zbraňovej komory a uvedomia si, že Vegnagun sa zrejme presťahoval do Farplane, ktorý sa nachádza v jadre Spiry.
Nezhody medzi frakciami Spiry sa čoskoro prerušili a ďalej po zmiznutí Baralaia a Nooja, Gippal vodca New Yevon a Zväzu mládeže a Machine frakcii, resp. po návrate do podzemných oblastí Bevelle Gullwings objavovili chýbajúcu frakciu vodcu a diskutovali Vegnagune a dozvedieli sa, že stroj AI umožňuje detekovať nepriateľstvo a reagovať tým, že aktivuje sám seba a utečú. Ďalej sa ukázalo, že Nooj prišiel do Bevelle so zámerom zničiť Vegnagun skôr, ako nájsť ho a utiecť do Farplane. Potom sa dozvedia, že Paine kedysi bola priateľkou so všetkými tromi mužmi, poverených do oblasti, zatiaľ čo oni boli kandidátmi na Crimson Squad, elitnej skupiny, ktorá mala byť priradená k vedeniu Crusader cez Spiru.
O dva roky skôr v jaskyni pod Mushroom Rock Road s názvom "Deň zo žiaľu," tesne pred neúspešnou operáciou Mi'ihen, bola vykonaná v tíme jej finálnym výkonom. V jaskyni boli rôzne družstvá kandidátov zovretia pyreflies a zabili jeden druhého. Jediní preživšími boli Paine, Baralai, Gippal a Nooj, ktorí boli sami, na ktorom, keď sa ukázalo, čo videli o Vegnagune v jaskyni. Čoskoro potom, Nooj zastrelil jeho kamarátov a nechal ich zomrieť, oddeilo sa tak priateľstvo skupiny. Avšak, v tomto okamihu, sa ukázalo, že sa nejedná o jeho vlastnú vôľu, keď ich zastrelil. Tieto pocity, ktoré riadili členov družstva k zabitiu jeden na druhého sa ukázalo, že boli zúfalí z protivníka, Shuyina, ktorý zomrel pred 1000 rokmi. Než štyria preživší opustili jaskyňu, duch Shuyina, vyžadoval hostiteľa, aby sa vzájomne so svetom spojili a bol posadnutý Noojom, ktorý neskôr bol prinútený strieľať na svojich kamarátov. V tej dobe, pretože, Shuyin bol spojený s Noojom na podvedomej úrovni, nútil ho, aby pristupoval k Vegnagunu, tak že on mohol používať Noojove telo.
Noojova vôľa bola príliš silná, lebo jeho túžbou bolo zničiť veľkú machinu zbraň a Shuiyn sa vyzval k úteku. Teraz si praje nového hostiteľa a Shuyin opustí Noojovo telo a má Baralaiovo, naháňa Vegnagun na Farplane. Nooj a Gippal ho v snahe nasledovali a žiadali Yunu, aby udržala veci pod kontrolou na povrchu. Pritom Yuna musela bojovať a poraziť každý vek, ktoré boli v predchádzajúcej čast Final Fantasy X a ich duše sa poškodené v zúfalstve Shuyina na Farplane. Počas tejto misie, Yuna spadá do Farplane a stretne Shuyina, ktorému chýba jeho láska, Lenne. Pocit náklonnosti k nemu, ktorý sa nechce vzdialiť od neho, a tak ona počúva ako Shuyin opisuje, ako sa "prebudil" potom, čo zomrel, a sám nemôže nájsť Lenne. On potom vyjadruje hnev, ktorý Spira občania pochopili smútok, že vojna môže spôsobiť, a ukáže, že on vytvoril plán používať starého Vegnaguna a zničiť celú Spiru. On verí, že on bude robiť lepšie miesto svetu.
Hráč sa dozvie, že pred 1000 rokmi pred zápasom, Shuyin bol slávny blitzballovým hráčom v high-tech metropole Zanarkand a milovník populárnej speváčky a posolkyne Lenne. Shuyinove pamäte by potom tvorili Tidusa v sne Zanarkandu v udalostiach Final Fantasy X. Obaja žili počas vojny Zanarkand so silnejšou Bevelle, a počas vojny, Zanarkand nariadil všetkým poslom oddeliť sa od páru. Lenne zomrela v boji a Shuyin sa rozhodol, že jediným spôsobom je, ako ju zachrániť a infiltrovať od Bevelle a tak zobrať Vegnagun, a používať ho, aby zničil nepriateľov Zanarkandu. Avšak, Lenne vníma Shuyinove zámery, a nechce, aby mu dovolili vziať životy mnohých iných pre ňu a išli za ním. Keď Shuyin v Bevelle len začal pracovať s Vegnagunom v ovládacom paneli. No potom Lenne ho prosila, aby prestal. Shuyin prestal, ale skupina vojakov Bevelle prišla o chvíľku a zastrelili obidvoch. Smrteľne zranený Shuyin nedokázal počuť Lennnine povesi, že ona ho milovala pred tým, než zomrel.
V priebehu nasledujúcich 1000 rokov, Shuyin, jeho zúfalstvo a nevôľa nad ním opomenuli zachrániť Lennu viazanú na pyreflies a prinútili ho, aby zažil muky tú chvíľu "znovu a znovu a znovu." V priebehu doby jeho zúfalstva sa stali tak mocné, že začal hrať na jeho vlastných obetí, prišiel veriť, že, okrem toho, že zničí Spiru, stratí Lenne. Koná sa Yunin koncert, na ktorom sa ukážu Lennine spomienky.
Yune sa podarí vrátiť sa na povrch, a Gullwings usporiadajú koncert, na ktorom všetci v Spire vyzývajú. Navyše dressphere ktorú nosí Yuna sa ukázal, že mohlo byť tvorené pamäťou Lenne, čo vedie k guli obrazovky vyčnievajúcej pre všetkých návštevy počas koncertu. Svedkom obrazu Shuyina a Lenne na poslednú chvíľu Spira občania začínajú chápať neproduktívny charakter ich nezhôd. Hráč sa potom dozvie, že to bolo kvôli spomienkam Lenny a že Shuiyn si pomýlil Yunu za Lenne a ona cítila náklonnosť k nemu.
Hoci vo frakčnom boji bolo takmer to, že Shuyin uskutočnil svoj plán na zničenie Spiry s Vegnagunom. Gullwings spojili svoje sily so Syndikát Leblanc a opäť ich cesta k Farplane viedla k nájdeniu Gippala a Nooja. Pracovali spolu a podarilo sa im zničiť obriu machinu pred jeho udalosťou na zničenie Spiry. Nakoniec po konfrontácii Shuyinovi sa Lenne vedome vynorí a presvedčí ho, aby opustil svoje poslanie a zostal v pokoji. Poďakovala Yune a Lenne sprevádza Shuyina ku mieru na Farplane.
Následný fayth sa nachádza v Bevelle a predstúpi pred Yunu a potom sa spýta, či by si priala, aby "ho" znovu chcela vidieť. Ona odpovedala, že áno, a tak sa rozlúčila s fayth. Fayth lokalizuje Tidusa a posiela ho na ostrov Besaid, kde sa Yuna vracia domov a Tidus ju konečne stretne. Hráči, ktorí dosiahnu 100% dokončenie okrem oživenia Tidusa, uvidia ďalšie stretnutie Tidusa a Yuny v Zanarkande.