Philipp Lahm se narodil v Mnichově, kde i začala jeho profesionální fotbalová kariéra. Nastupoval za mnichovské mládežnické kluby Bayernu i GT Gern Mnichov. Od sezóny 2003/04 až do července 2005 byl Bayernem puštěn na hostování do VfB Stuttgart.
Těsně před jeho návratem do Mnichova se zranil. Přetrhl si křížové vazy a svůj návrat v dresu Bayernu měl až v prosinci 2005. Na mistrovství světa ve fotbale vstřelil Philipp Lahm úvodní gól celého mistrovství, trefil se v 6. minutě do sítě Kostariky. Tato branka byla i po skončení mistrovství považována za jednu z nejhezčích.